在本技術說明中,我們將示範如何使用 Creoptix WAVE 來準確測量弱鍵結分子的快速解離速率動力學。晶片匣設計實現了 150 ms 的超快速切換時間,現在便可輕鬆發現低效價活性化合物,使藥物發現更容易成功。
在基於片段之篩檢資料庫所找到的弱鍵結化合物,通常是以親和力而非動力學來進行排序。這是因為標準儀器缺乏測量快速解離速率之化合物的能力。然而,測量親和力而非解離速率,可能會產生大量偽陽性誤判結果,進而擴大工作流程並產生不必要的成本。
採用專有光柵耦合干涉法 (GCI) 技術,Creoptix WAVE 能為高達 10s-1 的快速解離速率提供解析。如此一來,便能對真正的活性化合物實現準確的早期選定,大幅提高效率。
透過測量甲基磺胺鍵結至碳酸酐酶 II 的動力學,我們說明了 Creoptix WAVEsystem 系統為快速解離速率實現卓越的分離解析,即使標的物與分析物有相當高的分子量比亦然。
動力學數據 | |||
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Creoptix WAVE | Biacore™ S51 | ||
kon (M-1 s-1) | 9.36 x 103 | kon (M-1 s-1)
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8.05 x 103 |
koff (s-1) | 2.86 | koff (s-1)
|
2.21 |
KD (uM) | 306 | KD (uM) | 274 |
表 1:Kinetic data compared to published data in Myszka, David G. “Analysis of small-molecule interactions using Biacore S51 technology.”Analytical biochemistry 329.2 (2004): 316-323.
圖例:(A) 甲基磺胺 (95.1 Da) 鍵結至碳酸酐酶 II (29 kDa) 的感應圖,透過與胺耦合固定在 WAVEchip PCH 流動式樣品載台流動式槽 1 的 8500 pg/mm2 上。數據在 40Hz 以 200 μl/min 的流動速率擷取。(B) 放大到結合階段 (左) 和解離階段 (右),下方個別的殘留物分佈圖顯示高度清晰的動力學分離解析。