機能
使いやすさ
EasySAXSのグラフィカルユーザーインターフェースから、ソフトウェアのすべての機能やパラメータ設定に簡単に効率よくアクセスできます。実験的なSAXSデータと分析結果は、2つのグラフィックペインに表示されます。
データはさまざまな方法で表示できます。たとえば、線形対数または両対数スケールを使用したり、Guinier、Guinier、Kratkyプロットで表示したりできます。メッセージペインに計算の進行状況が表示され、必要に応じてヒントや警告が表示されます。
すべてのデータ分析ステップ(すべての詳細を含む)は、プロジェクトファイルに保存できます。これにより、後で分析を再開したり、分析スキームを他のユーザーと共有したりすることができます。必要に応じて、すべてのデータをエクスポートして処理したり、他のソフトウェアで表示したりできます。
SAXSデータ分析オプション
EasySAXSソフトウェアには、SAXSデータ分析の完全なチェーンをサポートする包括的なツールボックスが含まれています。
- バックグラウンド減算やデスミアリングなどの一次データ処理
- Guinier分析による回転半径
- ナノ粒子の粒度分布
- 対相関関数分析による粒子形状
- Porod分析による表面積
- 散乱不変量およびPorod体積
- さまざまな粒子形状および粒子構造のモデルフィッティングおよびシミュレーション
- USAXSデータ分析
分析パラメータは、ソフトウェアの[オブジェクト検査ペイン]で簡単に設定できます。
ATSAS 、 Irena 、およびSASfitなどの公開されているSAXSソフトウェアパッケージを使用して、データをエクスポートし、さらに詳細な分析を行うことができます。
自動化とレポート作成
EasySAXSの自動モードを使用すると、初心者や経験の浅いユーザーでもすぐに作業を開始できます。事前に定義されたパラメータ設定を含む分析テンプレートを適用することで、複数のデータファイルの粒子/細孔のサイズ分布を自動分析できます。結果はカスタマイズ可能な分析レポートに要約され、ASCIIファイルとしてエクスポートされます。
EasySAXSには、豊富なサンプルタイプに適用できるさまざまな分析テンプレートが付属しています。また、特定のサンプル用に任意のテンプレートを作成することもできます。
ヘルプシステム
EasySAXSには、状況に応じた包括的なヘルプシステムが含まれています。すべてのタスクの段階的な手順、パラメータの説明、理論的な背景情報、科学文献の参照、いくつかの作業例が含まれています。追加のクイックスタートガイドでは、自動モードとインタラクティブモードでのソフトウェアの使用について説明します。
EMBLの世界的な科学者たちとのコラボレーション
EasySAXSで使用される一部のアルゴリズムは、ドイツのハンブルクにあるヨーロッパ分子生物学研究所(EMBL)のDmitri Svergun博士とそのチームが開発した有名なATSASソフトウェアスイートのコードに基づいています。これらのアルゴリズムには、対距離相関関数と、間接フーリエ変換計算によって可能になる粒子サイズ分布分析が含まれます。
ATSASは、生体高分子からの小角散乱データ分析に広く利用されているプログラムスイートです。希釈タンパク質溶液からScatterX78で得られた実験SAXSデータは、EasySAXSで前処理してからATSASにエクスポートし、さらに詳細な分析を行うことができます(例: 一次タンパク質形状の再構成)。
仕様
パッケージの内容
EasySAXSパッケージには、クイックスタートガイドと詳細な電子ヘルプ機能が含まれています。また、実験データの自動バッチ処理用の分析テンプレートや演習用のサンプルファイルも含まれています。EasySAXSは、Windows 7、Windows 8.1 (64ビット)、およびWindows 10 (64ビット)で動作します。
現在のバージョン: 2.2