Quais técnicas de interação biomolecular são usadas na pesquisa?
Compreender a interação entre moléculas, particularmente a cinética, pode responder a muitas perguntas, por isso não é surpresa que seja necessário analisá-la em muitas áreas de investigação.
Por exemplo, você pode precisar saber como uma molécula interage com um receptor para entender como a sinalização ocorre em um organismo. Ou você pode querer entender se, e com que rigidez, um medicamento se liga a um composto de interesse para a descoberta de medicamentos. A afinidade de ligação pode nos dizer isso, mas podemos obter mais detalhes da medição da cinética de ligação.
As aplicações em que a cinética vinculativa é relevante são tão amplas quanto as tecnologias, e várias tecnologias podem ser usadas para estudá-las. Aqui comparamos três.
Observação: para obter mais informações sobre a medição de interações, termodinâmica e muito mais, consulte nossa página Tecnologia ITC.
O que é Interferometria de biocamada?
A Interferometria de biocamada (BLI) é uma tecnologia óptica, baseada em superfície e sem rótulo. Ao contrário de outras tecnologias de biossensores, a BLI não funciona com um fluxo microfluídico, mas por imersão das pontas dos sensores no buffer/amostra. A luz refletida na ponta de uma fibra óptica exibe uma mudança de fase dependendo do índice de refração próximo à superfície da ponta. A luz refletida interfere com a luz refletida de uma superfície de referência interna.
Usando luz branca como fonte, um padrão de interferência espectral é registrado. Esse padrão inclui informações sobre o índice de refração próximo à superfície da ponta. À medida que as biomoléculas se ligam à superfície da biocamada imersa na solução experimental (como uma amostra), o perfil do índice de refração e, portanto, o padrão espectral se alteram.
Vantagens
- Facilidade de uso
- Praticamente sem entupimentos para amostras complexas e pegajosas
- Efeitos em massa minimizados usando dicas de referência
Desvantagens
- Os sensores são muito menos sensíveis em relação a ordens de magnitude do que os sensores SPR e GCI
- Precisão limitada ao determinar parâmetros cinéticos
- Capacidade limitada de medir ligantes rígidos e taxas de associação rápidas; medições limitadas por difusão
- Capacidade limitada de medir taxas de dissociação rápidas
O que é Ressonância plasmônica de superfície?
A Ressonância plasmônica de superfície (SPR) é outro método de análise óptica sem rótulo. Na verdade, essa foi uma das primeiras tecnologias sem rótulo baseadas em superfície. A SPR detecta alterações no índice de refração causadas por interações moleculares dentro de um campo evanescente próximo a uma superfície do sensor.
Nesses sensores, uma película de metal em um suporte de vidro é iluminada com luz de um comprimento de onda específico. Em um ângulo específico, dependendo do índice de refração próximo à superfície, os chamados plasmons de superfície são excitados. Uma vez que falta essa energia no feixe de luz refletido, é formada uma intensidade de "imersão" durante a projeção no sensor.
Ao determinar a posição da imersão em tempo real, a SPR mede as alterações no índice de refração na superfície metálica. As soluções que contêm o analito são injetadas usando microcanais, e pelo menos uma célula de fluxo de referência é usada para eliminar efeitos em massa.
Vantagens
- As células de fluxo de referência eliminam efeitos em massa
- Pode medir ligantes rígidos e taxas de associação rápidas
Desvantagens
- Detecção limitada de transições mais rápidas devido ao uso de células de fluxo em série
- Os microfluídicos tradicionais requerem alta manutenção devido à obstrução
- Capacidade limitada de medir taxas de dissociação rápidas
O que é a Interferometria acoplada a grade (GCI)?
Com base na interferometria da guia de onda, outro método ótico sem rótulo, a Interferometria acoplada a grade (GCI) pode monitorar e caracterizar interações moleculares em tempo real, determinando parâmetros de taxa cinética, constantes de afinidade e concentrações de moléculas de analito interagindo com um ligante imobilizado.
Na interferometria da guia de onda, as alterações no índice de refração são medidas dentro do campo evanescente de uma guia de onda próxima a uma superfície do sensor. Essas alterações fazem com que a fase de luz também mude. A luz percorre toda a guia de onda, criando uma onda evanescente que se estende por todo o comprimento da superfície do sensor. As alterações de fase são exibidas interferometricamente. A tecnologia GCI da Creoptix aproveita os benefícios da interferometria da guia de onda e elimina seus problemas típicos de alinhamento:
Vantagens
- Alta sensibilidade primária para análise de interação sem rótulo
- Microfluídicos sem entupimento
- Pode medir ligantes rígidos e taxas de associação rápidas
- Pode medir cinética com taxas de dissociação rápidas
BLI x SPR x GCI: Qual técnica de interação biomolecular é a melhor?
A melhor técnica de interação biomolecular dependerá da aplicação e dos objetivos do usuário. Abaixo, você pode ver como essas três técnicas se comparam em relação a quatro requisitos principais: uma ampla faixa de aplicação, medição de ligantes mais fracos, medição de ligantes mais rígidos e baixa manutenção do sistema.
Interferometria acoplada a grade (GCI) | Ressonância plasmática de superfície (SPR) | Interferometria de biocamada (BLI) | |
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Gama de aplicações mais ampla Adequada a uma variedade de moléculas que vão desde massas moleculares baixas a altas, purificadas ou brutas. | Sim Adequada a fragmentos, pequenas moléculas, peptídeos, proteínas, vírus, sobrenadantes de culturas celulares, soros, lisados celulares | Não Adequada a pequenas moléculas, peptídeos (adequação limitada para fragmentos, vírus, sobrenadantes de culturas celulares, soros, lisados celulares) | Não Adequada a sobrenadantes de culturas celulares, soros, lisados celulares (adequação limitada para peptídeos, proteínas, vírus) |
Meça os aglutinantes mais fracos Capacidade de medir a cinética com taxas de dissociação rápidas graças à rápida fluídica e a altas taxas de aquisição. | Sim Taxas de dissociação de até kd=10 s-1 | Não Taxas de dissociação de até kd=1 s-1 | Não Taxas de dissociação de até kd=0,1 s-1 |
Meça os aglutinantes mais rigorosos Capacidade de medir com precisão a cinética, mesmo em aglutinantes rigorosos e taxas de associação rápidas. | Sim Medição em condições de fluxo | Sim Medição em condições de fluxo | Não Medição em condições com difusão limitada (sem microfluídicos) |
Baixa manutenção do sistema Pouco tempo de inatividade devido a manutenções ou reparos inesperados. | Sim Microfluídicos sem entupimento | Não Microfluídicos tradicionais | Sim Sem microfluídicos |