이 기술노트에서는 도파관 간섭법(GCI) 기술이 고감도로 측정하는 확장된 감지 영역 덕분에 어떻게 Creoptix WAVE를 사용하여 큰 표적-분석물 분자량(MW) 비율(>300:1)의 결합 동역학을 정확하게 모니터링할 수 있는지 보여줍니다.
소분자와 약물 표적 사이의 상호작용에 대한 실시간 무표지 분석은 약물 발견 과정을 안내하고 유망한 약물 후보물질을 식별하는 데 유용한 정보를 제공합니다. 그러나 약한 결합체와 큰 표적-분석물 분자량(MW) 비율은 동역학 특성 분석을 매우 어렵게 만들 수 있습니다. 고감도로 측정하고 신속한 해리 속도(koff)를 확실하게 측정할 수 있는 능력이 필요한 경우가 많기 때문입니다.
독점 도파관 간섭법(GCI) 기술을 사용하는 Creoptix® WAVE 는 동급 최고의 감도를 제공하여 낮은 신호 수준에서도 매우 정확한 동역학 데이터를 생성할 수 있습니다. 완강한 미세유체 기술과 결합된 GCI는 아세토니트릴 또는 고농도 DMSO와 같은 비공통 용제가 존재할 때 분자 상호작용을 특성 분석할 수 있습니다.
여기서는 카보닉 안히드라제 II(CAII)의 다양한 소분자 억제제의 결합 동역학을 측정하여 Croptix WAVE가 작고 약한 결합 약물 분자에 대해 뛰어난 분해능을 달성하여 표적 대 분석물 분자량 비율에 관계없이 완전한 동역학 특성 분석을 수행함을 보여줍니다.
| 1 푸로세미드 | 2 4-술파모일벤츠 산 | 3 술파닐아미드 | 4 메틸술폰아미드 | 5a 아세타졸아미드 | 5b 아세타졸아미드 | |
|---|---|---|---|---|---|---|
| MW(Da) | 330.74 | 201.20 | 172.20 | 95.12 | 222.25 | 222.25 |
| 고정화 수준(pg/mm2) | 6050 | 6050 | 6050 | 6050 | 6050 | 1450 |
| 동역학 데이터 | ||||||
| kon(M-1.s-1) | 3.75x1044 | 2.98x104 | 2.67x104 | 1.15x104 | 1.31x106 | 1.22x106 |
| koff(s-1) | 0.051 | 0.040 | 0.180 | 3.37 | 0.038 | 0.031 |
| km | - | - | - | - | 1.17x107 | - |
| Rmax(pg/mm2) | 30.87 | 16.91 | 12.09 | 3.79 | 13.25 | 4.59 |
| KD(μM) | 1.4 | 1.3 | 293 | 293 | 0.029 | 0.026 |
| 평형 데이터 | ||||||
| Rmax(pg/mm2) | 33.37 | 14.57 | 11.75 | 3.34 | 14.05 | 4.83 |
| KD(μM) | 2.4 | 3.8 | 6 | 270 | 0.048 | 0.028 |
표 1: 카보닉 안히드라제 II(CAII)의 다양한 소분자 억제제의 동역학 및 평형 데이터
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그림 1: 카보닉 안히드라제 II(CAII)의 다양한 소분자 억제제의 결합 동역학
