Viscotek SEC-MALS 20을 이용한 단백질 응집 측정

이 응용 노트에서는 선별한 단백질을 크기 배제 크로마토그래피(SEC)를 이용하여 분리합니다. SEC-MALS로 올리고머와 응집체의 분자량을 측정하고 결과에 대해 논의합니다.

서론

바이오제약 산업에서는 단백질 응집이 주요 문제로 인식되고 있습니다.  단백질은 시간의 경과에 따라 응집되는 경향이 있으며 생물학적 약물은 응집체의 존재가 면역 반응을 자극할 위험이 있습니다.  크기 배제 크로마토그래피(SEC)는 단백질 응집을 연구하는 데 일반적으로 사용하는 강력한 도구입니다.

SEC는 단백질을 크기로 분리합니다.  분자량을 측정하고 응집을 특성화하는 데 일반적으로 사용됩니다. 대부분의 SEC 시스템이 자외선(UV)과 같은 단일 농도 검출기를 사용하지만, 광 산란을 추가할 경우 보존 체적과 상관없이 단백질의 분자량을 측정할 수 있습니다.  그런 다음 시료 내에 존재하는 모노머, 올리고머 및 응집체의 분자량을 측정하여 거동을 이해할 수 있습니다  또한 다각도 광 산란(MALS)을 사용하여 빛을 비등방성(각도 측면에서 고르지 않게)으로 산란시키는 분자의 회전 반경(Rg)을 측정할 수 있습니다.

Viscotek SEC-MALS 20 시스템(그림 1)은 용리 용적과 상관없이 단백질 및 단백질 응집체의 분자량을 측정할 수 있는 20개의 측정각을 가진 광 산란 장비입니다.  농도 검출기(RI, UV), 고유 점도(IV), 동적 광 산란(DLS) 등의 검출기를 추가할 경우 단일 SEC 측정에서 이용 가능한 정보의 양이 크게 증가합니다.  이 응용 노트에서는 선택한 단백질을 SEC를 이용하여 분리합니다.  SEC-MALS로 올리고머와 응집체의 분자량을 측정하고 결과에 대해 논의합니다.

Viscotek SEC-MALS 20 시스템
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재료 및 방법

농도를 측정하기 위해 TDA RI 검출기와 연결한 후 SEC-MALS 20 시스템과 Viscotek TDAmax 시스템을 연결하였습니다.  시료는 2x Viscotek 단백질 컬럼을 사용하여 분리하였습니다.  이동상은 인산완충식염수였으며 모든 시료는 이동상에 용해시켰습니다.  분자량 특성이 잘 알려진 단백질인 소혈청알부민을 사용하여 SEC-MALS 시스템을 보정했습니다.  분리를 원활히 진행하고 검출기의 기준선 안정성을 극대화할 수 있도록 검출기와 컬럼을 모두 30°C에서 보관했습니다.

결과

BSA 시료는 일반적으로 모노머, 올리고머, 큰 응집체가 결합되어 있습니다.  여기서, 모노머, 다이머, 트라이머 피크는 분명히 볼 수 있으며 해당 분자량은 MALS로 정확하게 측정했습니다.  시료에는 개별적으로 분석되지 않는 다분산 상태의 응집체도 일부 포함되어 있습니다.  그림 2에 BSA 크로마토그램이 나와 있으며 BSA 측정의 결과는 표 1에 나와 있습니다. 

그림 1: 굴절률(빨강) 및 SEC-MALS(90°)(주황) 검출기 신호를 보여주는 BSA의 크로마토그램. SEC-MALS로 측정한 분자량은 검정으로 오버랩되어 있습니다.
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표 1: BSA 시료에 함유된 구성요소의 분자량
응집체트라이머다이머모노머
Peak RV - (ml)13.8414.3115.3717.05
Mn - (kDa)337.3199.4133.666.1
Mw - (kDa)378.3201.2133.966.3
Mw/Mn1.1221.0091.0031.002
Rg(w) - (nm)N/CN/CN/CN/C
Wt Fr (Peak)0.040.0570.4230.745

모노머, 다이머, 트라이머 피크의 분자량이 매우 안정적임을 분명히 확인할 수 있습니다.  이러한 특성은 단백질이 개별적으로 분자량이 매우 밀접하게 제어되고 단분산으로 간주되는 경우 일반적입니다.  이러한 분자량은 안정적이어서 올리고머임을 나타내지만, 다분산 개체군으로 구성된 초기의 용리 물질에서는 분자량 추적이 더욱 가변적입니다.  이러한 특성은 변성되어 더 이상 기능하지 않을 가능성이 높은 응집체에서 일반적으로 나타납니다.  각 피크에서 전체 시료 중 비율은 'Wt Fr' 행에 식별되어 있습니다.

두 번째 조사한 단백질은 사이로글로불린이며 해당 크로마토그램은 그림 2에 있습니다.  다른 각도의 MALS 신호는 그림 3의 MALS 도표에 나와 있으며 계산 결과는 표 2에 있습니다.

그림 2: 굴절률(빨강) 및 SEC-MALS(90°)(주황) 검출기 신호를 보여주는 사이로글로불린의 크로마토그램 SEC-MALS로 측정한 분자량은 검정으로 오버랩되어 있습니다.
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그림 3: 사이로글로불린에 대한 SEC-MALS 검출기 신호의 크로마토그램
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표 2: 사이로글로불린 시료를 다양한 피크에서 측정한 분자량
응집체모노머
Peak RV - (ml)11.6012.50
Mn - (kDa)1601.0681.5
Mw - (kDa)2588.0686.0
Mw/Mn1.6171.007
Rg(w) - (nm)N/CN/C
Wt Fr (Peak)0.1670.833

사이로글로불린 시료는 RI 검출기를 따를 경우 2개 피크로 분리되지만 SEC-MALS 검출기를 따를 경우 3개로 분리됩니다.  SEC-MALS 검출기는 RI 검출기에만 표시되는 매우 큰 응집체 중 극소량을 식별합니다. 

모노머의 분자량은 686kDa로 측정되었습니다.  이 수치는 사이로글로불린 분자량 669kDa의 3% 이내입니다.  피크 전체적으로 안정적이어서 이 개체군이 단분산임을 나타냅니다.  단일 성분으로 분석된 응집체 피크는 더 높고 가변적인 (다분산) 분자량을 나타내며 무질서한 응집체임을 분명히 알 수 있습니다.  이 피크의 단백질이 활동성이 있을 가능성은 거의 없으며 제약 시료였을 경우 이러한 응집체는 면역반응을 일으킬 가능성이 높습니다.  응집체는 시료의 약 17%를 차지하고 있습니다.  이 단백질의 분자량이 높음에도 불구하고 SEC-MALS 디스플레이에서 모노머와 응집체의 분산이 등방성임을 분명히 알 수 있습니다.  그러므로 이 시료에서는 모든 피크의 Rg를 측정할 수 없습니다.

마지막으로 측정한 시료는 펩신이었으며 해당 크로마토그램은 그림 4에 나와 있습니다.  다른 각도의 SEC-MALS 신호는 그림 5의 MALS 도표에 나와 있으며 계산 결과는 표 3에 있습니다.

그림 4: 굴절률(빨강) 및 SEC-MALS(90°)(주황) 검출기 신호를 보여주는 펩신의 크로마토그램 SEC-MALS로 측정한 분자량은 검정으로 오버랩되어 있습니다.
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그림 5: 펩신에 대한 SEC-MALS 검출기 신호의 크로마토그램
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표 3: 펩신 시료를 다양한 피크에서 측정한 분자량
응집체모노머분해 제품
Peak RV - (ml)10.8418.3320.92
Mn - (kDa)3892.034.44.7
Mw - (kDa)4431.034.76.4
Mw/Mn1.1381.0081.364
Rg(w) - (nm)69.9N/CN/C
Wt Fr (Peak)0.0080.5690.423

펩신 시료를 2개의 주요 피크로 분리했습니다.  두 번째 피크의 분자량은 34.7kDa로 측정되었으며, 이 수치는 펩신의 알려진 분자량인 35kDa에 매우 가깝습니다.  더 큰 피크에는 더 높고 가변적인 분자량이 있어 활동성이 거의 없는 무질서한 응집체임을 분명히 알 수 있습니다.  이와 같이 큰 광 산란 피크임에도 불구하고, 응집체는 시료의 전체 물질 중 1% 미만을 차지합니다.  이 경우 MALS 도표에서 이러한 응집체가 비등방성 산란체임을 확실히 알 수 있습니다.  즉, 해당 Rg를 실제로 측정할 수 있으며, 해당 수치는 표에 거의 70nm로 표시되어 있습니다.  펩신은 비원형 구조이므로 동일한 분자량의 단백질의 경우보다 일반적으로 크기가 크다는 것을 의미합니다.  응집체의 크기는 응집체에서 구조가 실제로 지속되며, 그런 다음 매우 커지는 것을 나타냅니다.  이 경우는 펩신 응집체 분자량의 절반을 초과하는데도 크기가 훨씬 작은(<15nm) 사이로글로불린 응집체와 비교됩니다.  펩신 모노머는 너무 작아 Rg 측정을 수행할 수 없습니다.

시료에 확실히 정의되지 않은 세 번째 피크가 있지만 약 6kDa로 분자량을 갖는 것을 알 수 있습니다.  이 펩신 시료는 소화 효소로 자신을 소화시키고 있을 가능성이 높고, 일부 소화되고 있음을 결과를 통해 알 수 있습니다.

고 찰

이 응용 노트는 Viscotek SEC-MALS 20 시스템을 사용하여 다양한 단백질의 분자량 및 응집체를 성공적으로 측정하는 방법을 보여 주었습니다.  이 장비는 단백질의 용리 용적 또는 구조와 상관없이 단백질 분자량을 측정할 수 있습니다.  BSA 올리고머, 사이로글로불린, 펩신 응집체의 분자량을 성공적으로 측정하고 해당 양을 수량화했습니다.  응집체의 크기가 충분이 클 경우 해당 크기(Rg)도 측정할 수 있습니다.

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