특징
사용 편이성
EasySAXS의 그래픽 사용자 인터페이스를 통해 모든 소프트웨어 기능 및 매개변수 설정에 쉽고 효율적으로 액세스할 수 있습니다. 실험 SAXS 데이터 및 분석 결과는 두 개의 그래픽 창에 표시됩니다.
데이터는 lin/log 또는 log/log 스케일을 사용하거나 Guinier, Porod 또는 Kratky 플롯과 같은 다양한 방법으로 표시할 수 있습니다. 메시지 창에 계산 진행률이 표시되고 필요한 경우 힌트와 경고가 표시됩니다.
모든 세부 정보를 포함한 모든 데이터 분석 단계를 프로젝트 파일에 저장할 수 있습니다. 이렇게 하면 나중에 분석을 다시 시작하거나 분석 체계를 다른 사람과 공유할 수 있습니다. 필요한 경우 추가 처리를 위해 모든 데이터를 내보내거나 다른 소프트웨어와 함께 표시할 수 있습니다.
SAXS 데이터 분석 옵션
EasySAXS 소프트웨어에는 SAXS 데이터 분석의 전체 체인을 지원하는 포괄적인 툴박스가 포함되어 있습니다.
- 기본 데이터 처리(예: 백그라운드값 제거 및 디스미어링
- Guinier 분석에 의한 회전 반경
- 나노입자 크기 분포
- 쌍 분포 함수 분석에 의한 입자 형상
- Porod 분석에 의한 표면적
- 산란 불변자 및 Porod 체적
- 다양한 입자 형상 및 구조에 대한 모델 피팅 및 시뮬레이션
- USAXS 데이터 분석
분석 파라미터는 소프트웨어의 개체 검사 창(Object Inspection Pane)에서 편리하게 설정할 수 있습니다.
ATSAS , Irena 및 SASfit과 같은 공개된 SAXS 소프트웨어 패키지를 사용하여 심층 분석을 위해 데이터를 내보낼 수 있습니다.
자동화 및 보고
초보자와 경험이 부족한 사용자는 EasySAXS의 자동 모드를 사용하여 빠르게 시작할 수 있습니다. 사전 정의된 매개변수 설정이 포함된 분석 템플릿을 적용하여 여러 데이터 파일의 입자 및 공극 크기 분포 분석을 자동화할 수 있습니다. 그런 다음 사용자 지정 가능한 분석 보고서에 결과를 요약하고 ASCII 파일로 내보냅니다.
여러 샘플 유형에 적용 가능한 다양한 분석 템플릿이 EasySAXS와 함께 제공됩니다. 또한 사용자는 특정 관심 샘플을 위한 자체 템플릿을 만들 수도 있습니다.
도움말 시스템
EasySAXS에는 상황에 맞는 포괄적인 도움말 시스템이 포함되어 있습니다. 여기에는 모든 작업에 대한 단계별 지침, 매개변수 설명, 이론적 배경 정보, 과학 문헌에 대한 참조 및 일부 작업 예시가 포함되어 있습니다. 추가로 빠른 시작 설명서는 자동 및 인터랙티브 모드에서 소프트웨어의 사용 개념을 탐색하는 데 도움이 됩니다.
EMBL의 세계적인 과학자들과 협업
EasySAXS에 사용되는 알고리즘 중 일부는 독일 함부르크의 유럽 분자생물연구소(EMBL) 소속 Dr. Dmitri Svergun과 그의 팀이 개발한 유명한 ATSAS 소프트웨어 제품군의 코드를 기반으로 합니다. 여기에는 간접 푸리에 변환 계산으로 가능한 쌍 거리 분포 함수 및 입자 크기 분포 분석이 포함됩니다.
ATSAS는 생물 고분자의 소각 산란 데이터 분석을 위한 유명한 프로그램 제품군입니다. 희석된 단백질 용액에서 ScatterX78로 획득한 실험 SAXS 데이터는 EasySAXS로 사전 처리된 다음 ATSAS로 내보내게 되어 ab initio 단백질 형태 재구성 등의 심층 분석 대상이 될 수 있습니다.
사양
전체 패키지
EasySAXS 패키지에는 빠른 시작 설명서와 자세한 전자 도움말 기능이 포함되어 있습니다. 또한 실험 데이터의 자동 배치 처리를 위한 분석 템플릿과 연습 수행을 위한 예시 파일이 포함되어 있습니다. EasySAXS는 Windows 7, Windows 8.1(64비트) 및 Windows 10(64비트)에서 실행됩니다.
현재 버전: 2.2