La pandemia de COVID-19, causada por el nuevo coronavirus SARS-CoV-2, ha provocado una crisis sanitaria y económica mundial de una escala sin precedentes. La alta transmisibilidad del SARS-CoV-2, combinada con la falta de inmunidad de la población y la prevalencia de desenlaces clínicos graves, insta al rápido desarrollo de contramedidas terapéuticas eficaces.
En este informe, se trasmite la generación de nanoanticuerpos sintéticos, conocidos como sybodies, contra el dominio de unión al receptor (RBD) del SARS-CoV-2. En un proceso expeditivo que tomó solo doce días hábiles, se seleccionaron los sybodies enteramente in vitro de tres grandes bibliotecas combinatorias, mediante el despliegue de ribosomas y fagos. Obtuvimos seis grupos de sybodies fuertemente enriquecidos contra el RBD aislado e identificamos 63 sybodies antiRBD únicos que también interactuaron en el contexto del ectodominio de la espícula del SARS-CoV-2 de longitud completa.
La pandemia de COVID-19, causada por el nuevo coronavirus SARS-CoV-2, ha provocado una crisis sanitaria y económica mundial de una escala sin precedentes. La alta transmisibilidad del SARS-CoV-2, combinada con la falta de inmunidad de la población y la prevalencia de desenlaces clínicos graves, insta al rápido desarrollo de contramedidas terapéuticas eficaces.
En este informe, se trasmite la generación de nanoanticuerpos sintéticos, conocidos como sybodies, contra el dominio de unión al receptor (RBD) del SARS-CoV-2. En un proceso expeditivo que tomó solo doce días hábiles, se seleccionaron los sybodies enteramente in vitro de tres grandes bibliotecas combinatorias, mediante el despliegue de ribosomas y fagos. Obtuvimos seis grupos de sybodies fuertemente enriquecidos contra el RBD aislado e identificamos 63 sybodies antiRBD únicos que también interactuaron en el contexto del ectodominio de la espícula del SARS-CoV-2 de longitud completa.
Entre los sybodies seleccionados, se encontró que seis se unían a la espícula viral con afinidad nanomolar de dos dígitos, y cinco de ellos también mostraron una inhibición sustancial de la interacción RBD con la enzima convertidora de angiotensina humana 2 (ACE2). Además, identificamos un par de sybodies antiRBD que pueden unirse simultáneamente a la RBD.
Se prevé que los aglutinantes compactos como estos sybodies podrían convertirse en un fármaco inhalable que pueda usarse como una profilaxis conveniente contra COVID-19. Además, la generación de antivirales polivalentes, mediante la fusión de los sybodies antiRBD con pequeños aglutinantes adicionales que reconozcan epítopos secundarios, podría aumentar el potencial terapéutico y proteger contra los mutantes de escape.
Presentamos información de secuencia completa y protocolos detallados para los sybodies identificados, como un recurso de libre acceso.
