Análise cinética sensível de pequenas moléculas que se ligam a grandes alvos de medicamentos

Nesta nota técnica, mostramos como o WAVE da Creoptix pode ser usado para monitorar com precisão a cinética de ligação de grandes proporções de peso molecular (MW) alvo para analito (>300:1), graças ao campo de detecção expandido sobre o qual a tecnologia de Interferometria acoplada a grade (GCI) mede a alta sensibilidade.

A análise em tempo real e sem rótulos das interações entre moléculas pequenas e alvos de medicamentos fornece informações valiosas para orientar o processo de descoberta de medicamentos e identificar candidatos promissores a medicamentos. No entanto, aglutinantes fracos e grandes proporções de peso molecular (MW) de alvo para analito podem tornar a caracterização cinética extremamente desafiadora, uma vez que muitas vezes exigem alta sensibilidade e a capacidade de medir com confiança as taxas de dissociação rápidas (kdissociado). 

Usando uma tecnologia patenteada de Interferometria acoplada a grade (GCI), o WAVE da Creoptix® fornece a melhor sensibilidade da categoria para permitir que dados cinéticos altamente precisos sejam gerados em níveis de sinal ainda baixos. Combinada com a robusta tecnologia microfluídica, a GCI permite a caracterização de interações moleculares na presença de solventes não comuns, como acetonitrilo ou altas concentrações de DMSO.

Medindo a cinética de ligação de vários inibidores de moléculas pequenas da anidrase carbônica II (CAII), mostramos como o WAVE da Creoptix alcança uma resolução excepcional para moléculas de medicamentos pequenos, com ligação fraca, para caracterização cinética total, independentemente da relação peso molecular de alvo para analito. 

1 Furosemida 2 Ácido 4-sulfamoil benzoico 3 Sulfanilamida 4 Metil-sulfonamida 5a Acetazolamida 5b Acetazolamida
MW (Da) 330,74 201,20 172,20 95,12 222,25 222,25
Nível imob. (pg/mm2) 6050 6050 6050 6050 6050 1450
Dados cinéticos
kassociado (M-1.s-1) 3,75 x 1044 2,98 x 104 2,67 x 104 1,15 x 104 1,31 x 106 1,22 x 106
kdissociado (s-1) 0,051 0,040 0,180 3,37 0,038 0,031
km - - - - 1,17 x 107 -
Rmáx (pg/mm2) 30,87 16,91 12,09 3,79 13,25 4,59
KD (μM) 1,4 1,3 293 293 0,029 0,026
Dados de equilíbrio
Rmáx (pg/mm2) 33,37 14,57 11,75 3,34 14,05 4,83
KD (μM) 2,4 3,8 6 270 0,048 0,028

Tabela 1: Dados cinéticos e de equilíbrio de vários inibidores de pequenas moléculas da anidrase carbônica II (CAII)

[Figura 1 TN201001-Creoptix-kinetic-analysis-small-molecule-binding.jpg] Figura 1 TN201001-Creoptix-kinetic-analysis-small-molecule-binding.jpg

Figura 1: cinética de ligação de vários inibidores de pequenas moléculas da anidrase carbônica II (CAII)

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